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我校原是一所为地面炮兵培养初级指挥军官的军事院校。1951年1月，西北军区司令员彭德怀、政治委员*签署命令，由西北军区炮兵教导团与第一野战军野炮团合并改编西北军区炮兵学校。1951年3月，更名为中国人民*第一炮兵学校。1955年8月，迁至西安。1956年2月，更名为中国人民*西安炮兵学校。
为打破西方大国的核讹诈、核垄断，加快我国战略导弹部队组建步伐，先行培养我国自己的导弹人才，1959年6月，党中央、中央军委决定，学校结束地面炮兵培训任务，以西安炮兵学校为依托，长辛店炮兵教导大队训练力量为骨干，吸收空军十五航校部分教员学员，改建炮兵特种技术性质院校，为保密起见，沿用西安炮兵学校名称。9月1日，工程一期、技师一期学员开学，标志着我国第一所为战略导弹部队培养人才的高等军事院校光荣诞生。
1963年1月，更名为中国人民*炮兵技术学院。1969年10月，转隶第二炮兵，12月更名为第二炮兵技术学院。1975年8月，更名为第二炮兵学校。1978年1月，更名为第二炮兵技术学院。1986年6月，更名为第二炮兵工程学院。2011年6月，改建为第二炮兵工程大学。
1959年以来，学校先后为部队培养输送了三万多名毕业学员，其中，成长为将军的100多名。目前，第二炮兵导弹旅绝大多数的旅长、参谋长、总工程师和导弹营、连长都是我校毕业学员，成为二炮部队建设的骨干和中坚。
学校人才培养目标：培养造就战略导弹部队骨干人才和未来领导者。
学校办学定位：教学研究型综合大学，是二炮人才培养的重要基地、科技攻关的重要力量、理论创新的重要阵地、决策咨询的重要依托、文化传承的重要园地、军事外交的重要窗口。
